Det kan bli dyrt att ta bilen till Arlanda i framtiden om Luftfartsverket får igenom sin plan att införa biltullar. Anledningen är att man vill minska biltrafiken till och från Arlanda. För att utöka möjligheterna att enkelt kunna ta sig till Arlanda ska SL utöka kollektivtrafiken med en ny pendeltågslinje. Den ska gå från Älvsjö, via Stockholm central och vidare till Arlanda och Uppsala och beräknas vara klar år 2012. Detta innebär ett problem för Luftfartsverket eftersom det är de som ansvarar för alla utsläpp från Arlandas trafik, både flygtrafiken och vägtrafiken till och från flygplatsen. Ekvationen med den utökade kollektivtrafiken och försöket att uppfylla tillståndets alla krav går inte ihop. Därför ansökte Luftfartsverket om att få göra ändringar i miljövillkoren men fick ett nej i november från Miljödomstolen. Efter det har Luftfartsverket överklagat till en högre instans och medan de väntar kan en lösning på utsläppsfrågan bli att införa tullar för alla biltrafikanter där en del av intäkterna eventuellt skulle gå till att finansiera den nya pendeltågslinjen.